Casa de Agonia denuncia o uso da hierarquia e da disciplina, bases sagradas do militarismo, como ferramentas de opressão que satisfazem os caprichos de chefes autoritários na Marinha do Brasil. Mário Lima Jr. – que serviu durante seis anos na graduação de marinheiro – defende que jurar o sacrifício da própria vida pela Pátria confunde os militares, de todos os postos e graduações, que suportam calados arbitrariedades ameaçadoras da dignidade humana, o oposto do que prega o Juramento à Bandeira Nacional.
“Há 106 anos a Marinha punia seus homens com chibatadas nos conveses dos navios. Em breve julgaremos igualmente abomináveis as prisões em cadeias militares e a privação da liberdade através do impedimento a bordo por motivos torpes, que acontecem até hoje”.